湖北省武汉市新冠肺炎疫情发生后，全国各地启动重大突发公共卫生事件一级响应，塔吉克斯坦政府也升级入境管控措施。在重大疫情面前，塔吉克斯坦中国企业商会旗帜鲜明地服从驻塔使馆和经商处领导，坚决贯彻和落实使馆、经商处对防控新冠肺炎的指示和部署，配合使馆、经商处和塔国政府相关部门做好疫情防控。
“疫情就是命令，防控就是责任”，塔吉克斯坦中国企业商会心系祖国抗击疫情进展，在疫情发生后立即启动中国驻塔使馆、经商处和商会共同建立的紧急事件应急反应联络机制，在疫情预警、联合防控、人员健康监测、响应捐助倡议等方面，科学筹划，多措并举，坚决打赢疫情防控阻击战。
一是深入学习贯彻习近平总书记重要指示，要求各中资企业坚持员工生命高于一切的理念，把员工生命安全和身体健康放在第一位，把疫情防控工作作为当前最重要的工作来抓。二是成立商会疫情防控小组，在中国驻塔使馆和经商处的领导下，向在塔中资机构和中国公民发出疫情警告，部署健康防护，警惕病毒传播。三是发布《关于应对新型冠状病毒感染性肺炎防控办法并建立日报机制的通知》，要求各中资企业梳理疫情发展和员工出行情况，严格管控年前湖北停留返塔人员，全面评估存在的风险。四是建立疫情期间中资企业、商会、经商处及使馆三级日报制度，各单位每日上报员工健康状况，全面掌控在塔中国员工健康状况。
商会在积极部署疫情防控的同时，还鼓励在塔中资企业总部和驻塔机构履行企业社会责任，发挥自身资源优势，以多种形式支援疫情抗击战。在收到境外中资企业商(协)会联席会议办公室下发的支援抗击新冠肺炎的通知后，商会立即向各会员单位发出支援武汉抗击疫情的行动倡议，得到了各在塔中资企业的热烈响应。在商会的组织下，各企业按照自愿和量力而行的原则给疫区捐款捐物，助力祖国打赢抗击新冠肺炎攻坚战。
截止到2020年2月5日，在塔中国公民未发现新冠肺炎疑似病例，在塔中资企业为湖北省慈善总会捐款57000美元。
