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揭开基因芯片奥秘:建库上机

揭开基因芯片奥秘:建库上机
2023-07-11 12:04:45 来源:中华网湖北

随着基因科学的不断发展,基因芯片技术已经成为研究基因功能和疾病发生机制的重要手段之一。现基因芯片技术已经投入到农业生产之中,“猪芯片”是基因 芯片的一种,如何知道一头小猪将来长得快不快?肉好不好吃?一块“猪芯片”就能揭开谜底。

华中农业大学赴武汉影子基因科技有限公司实践团分组进入猪液相基因芯片的制作流程中操作学习,即“猪芯片”制作。7月7日,在武汉影子基因科技有限公司项目经理陈辉的引导下,实践团进入实验室认识建库上机操作。建库上机是基因芯片制作核心。

建库上机分为建库和上机两个联系紧密的操作。

建库是基因组文库的建立,建库有六个步骤:1)基因组DNA的抽提,抽提基因组以获取纯度较高的DNA,用于后续实验,如PCR、测序、生物鉴定等。2)基因组DNA的质控,基因组DNA采用琼脂糖凝胶电泳进行检测,测出未知片段的大小。3)设计并合成引物接头,根据illumina高通量测序要求,进行双向测序,设计目标区域和带有“5’接头-barcode-测序引物-特异引物-3’”的融合引物。4)PCR扩增,采用目的基因的特异引物,进行靶基因的扩增。5)PCR产物的纯化,除去过量的引物、Taq DNA酶及dNTP等。6)PCR产物的定量,保证测序产出的数据量在每个样本中保持相对一致。

揭开基因芯片奥秘:建库上机

学习建库操作后,有队员认为建库操作复杂繁多,但每一步都至关重要,它决定后续基因芯片的诞生和作用效果。在建库实验中学习移液、离心、PCR技术、磁珠法等多种操作。实践团一致认为熟练掌握各种操作技术是实验的基础,各岗位的工作人员已经对自己的操作了然于心。

上机实则为基因芯片的使用,通过DNA芯片上固定的探针或样品DNA与游离的样品DNA或探针杂交来推断未知靶分子,杂交发生与否可采用荧光标记技术检测,利用测序仪进行基因组DNA的测序,读取结果将用于指导生产实践。通过对目的基因的测序,“猪芯片”将成为指导猪生产、育种、种猪筛选的优良工具。

揭开基因芯片奥秘:建库上机

实践团队员胡航伟表示上机操作主要由测序仪进行,但前期材料准备、程序设定、结果分析都不容疏忽,每一步操作都是环环相扣的,保证每一步操作的准确,才能取得成功。

基因测定可以加快种猪的选择效率,提高遗传改良效率,利用“猪芯片”,可以判定这头猪,将来长的快不快,产的多不多,肉好不好吃。(通讯员:胡航伟 摄影:院怡帆)

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(责任编辑:金鹏)